Jedną ze znamiennych cech w logistyce branży farmaceutycznej jest bardzo duża rozpiętość artykułów, składowanych w różnych strefach magazynu o różnych wymaganiach i parametrach, w tym temperaturowych. Często uniemożliwia to stworzenie uniwersalnego procesu kompletacji i wymaga rozbicia go na kilka etapów, z wykorzystaniem różnych dostępnych technik. W przypadku centrum dystrybucji obsługującego bezpośrednie dostawy do aptek bardzo poważnymi wyzwaniami stają się serwis dostaw i struktura zamówień.